| 时间 | 荣誉 |
| 1988年 | 范驰怡被评为广东省卫生厅直属系统文明建设先进工作者，生测室为先进集体。 |
| 1988年 | 省卫生厅粤卫[1998]第463号文,我所中药室被评为《药品管理法》三周年药品监督先进集体,林惠蓉、范玉强、余锦雄被评为先进工作者。 |
| 1988年 | 编辑出版《广东省药品标准》(87版)，收载品种1690个。 |
| 1990年 | 业务办党小组被评为厅先进基层党组织。 |
| 1990年 | 我所通过广东省计量局组织的计量认证验收，成为厅直系统首家通过计量认证单位。 |
| 1990年 | 广东省召开贯彻《药品管理法》五周年，我所被评为先进单位。 |
| 1991年 | 林惠蓉、陈绍基主编《中药材鉴别图谱》被广州市评为91年全国书市展销会十大畅销书之一。 |
| 1993年 | 我所化学室党小组被评为广东省卫生厅直属系统先进基层组织。余锦雄被评为优秀党员，要春喜被评为优秀党务工作者。 |
| 1995年 | 省卫生厅粤卫[1995]58号，生化室被授予厅直属系统文明科室之一。余锦雄、黎旸被授予文明建设先进工作者。 |
| 1995年 | 我所被评为广东省卫生系统“三五”普法先进单位。被卫生部评为实施药品管理法十周年先进集体。 |
| 1995年 | 省科委粤科鉴字[1995]第114号文决定省药检所、太阳神公司的太阳神生物健口服液（甘菊型）是否含性激素的气-质联用测定方法研究，获科学技术成果鉴定证书，省卫生厅科技进步三等奖。 |
| 1996年 | 林伟强 药品检验所检品管理系统获卫生厅科技进步奖。 |
| 1997年 | 获共青团广东省卫生厅直属机关委员会举办的“九七香港回归知识竞赛”二等奖。 |
| 1997年 | 梁祈《十三种出口中成药中微量重金属检测方法与限量标准研究》获国家中医药局荣誉证书。 |
| 1997年 | 梁祈 《七种出口中成药中微量重金属检测方法与限量标准研究》获得省中医药局奖励证书。 |
| 1998年 | 我所综合档案室通过评审，晋升为“国家二级科技事业单位档案管理”。 |
| 1998年 | 获广东省卫生厅直属系统暨纪念党的十一届三中全会二十周年文艺汇演二等奖。 |
| 1999年 | 广东省卫生厅直属系统演讲比赛，陈华获第一名。 |
| 1999年 | 化学室被团省委、广东省卫生厅评为“青年文明号”。 |
| 2002年 | 获广东省药监局直属单位第一届职工运动会羽毛球团体亚军，乒乓球团体比赛季军，游泳团体比赛季军。 |
| 2003年 | 广东省药品监督管理局授予我所“广东省药品监督管理系统抗击非典先进集体”。 |
| 2003年 | 广东省经贸委、广东省医药行业协会授予我所“广东省医药行业抗击非典先进集体”。 |
| 2003年 | 获中共广东省食品药品监督管理局直属机关委员会先进基层党组织。 |
| 2003年 | 广东省食品药品监督管理局、广东省安全厅授予我所“广东省打击生产销售假劣药品、医疗器械违法犯罪专项行动先进集体”。 |
| 2004年 | 获中共广东省食品药品监督管理局直属机关委员会先进基层党组织。 |
| 2006年 | 所党委被广东省直机关评为“先进基层党组织”。 |
| 2007年 | 我所被评为广东省直机关排头兵实践活动“部门排头兵”。 |
| 2008年 | 我所被授予全国食品药品监督管理系统“先进集体”。 |
| 2009年 | 我所被省委、省政府授予“省文明单位”。 |
| 2010年 | 我所被越秀区授予“2009年度越秀区专利大户奖”。 |
| 2010年 | 我所被认定为2010年度广东省科技服务业百强企业。 |
| 2010年 | 我所被国家药典委员会授予“标准研究先进单位”。 |
| 2011年 | 我所被授予广州亚运会（亚残运会）餐饮服务食品安全和药品安全监督保障工作“先进集体”。 |
| 2011年 | 所党委被广东省直机关评为“先进基层党组织”。 |
| 2012年 | 我所被省直机关团工委命名为广东省直属机关 “青年文明号”。 |
| 2012年 | 所长罗卓雅被国家人社部和国家食品药品监督管理局授予“全国食品药品监督管理系统先进工作者”荣誉称号。 |
| 2012年 | 所长罗卓雅被全国医药卫生系统创先争优活动领导小组授予“全国医药卫生系统创先争优活动先进个人”。 |
| 2016年 | 我所被省直属机关妇女工作委员会被评为 “巾帼文明岗”。 |
| 2016年 | 所长罗卓雅被省总工会评为2016年 “南粤建功立业女能手”。 |
| 2016年 | 我所被评为全国食品药品监督管理系统先进集体。 |
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